Técnica electromagnética para disminuir costo del mapeo genómico

Los investigadores han desarrollado un método para la secuenciación simultánea de muchas cadenas de ADN, una mejora en metodología, que busca disminuir drásticamente el costo del mapeo genético.

El mapeo de los genomas humanos individuales tiene el problema de requerir técnicas incapaces de manejar los más de 3.000 millones de pares de bases que se tienen que secuenciar. Para resolver este problema y reducir el costo por paciente a mil dólares o menos (como lo solicitan los Institutos Nacionales de Salud de los Estados Unidos), investigadores en la Universidad de Brown (Providence, RI, EUA) combinaron el método estándar de electroforesis, traslocación a través de poros de ADN mediante voltaje, con una aplicación novedosa de tecnología de campo magnético. El problema principal de la técnica de electroforesis ha sido la gran velocidad a la que se mueven las moléculas de ADN a través del sitio de secuenciación de pares, lo cual conduce a determinaciones inexactas.

El primer paso en la técnica nueva fue unir las hebras de ADN a perlas de 2,8 micras de diámetro, usando el bien conocido método de la unión de avidina-biotina. Posteriormente se colocaron las hebras en un campo eléctrico que las inducía a pasar a través del gel con nanoporos de solo 10 nm de diámetro. Aunque las hebras de ADN podían pasar a través de los poros, las perlas no podían. A continuación, se aplicó un campo magnético en la dirección opuesta al campo eléctrico, y las hebras se halaron hacia afuera de los poros. En este momento, las secuencias de pares de bases podían ser identificadas con facilidad y claridad. Se podían manejar muchas hebras de ADN al mismo tiempo.

El autor principal, el Dr. Xinsheng Sean Ling, profesor de física en la Universidad de Brown, dijo que los investigadores llamaron su proceso, "traslocación reversa de ADN”. La velocidad de la traslocación será controlada no solamente por el campo eléctrico sino por el establecimiento de un equilibrio entre los campos magnéticos y eléctricos. Desde ahí, podemos afinarlo para definir la velocidad”.

"Cuando hay que secuenciar el genoma de alguien”, hay que hacerlo de manera económica, y rápida”, explicó el Dr.Ling. "Este es un paso en esa dirección”.

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Brown University